Le sol marseillais est dominé par le calcaire urgonien, particulièrement dans les collines et les calanques. Ce sol pauvre, caillouteux et très drainant convient parfaitement aux plantes méditerranéennes mais nécessite un apport de compost pour les cultures potagères. Le pH est généralement alcalin (7,5-8,5), ce qui exclut les plantes de terre de bruyère (rhododendrons, azalées) sans correction.
Le mistral, vent dominant du nord-ouest soufflant 100 à 120 jours par an, est un facteur clé du jardinage marseillais. Il dessèche les plantes, casse les branches fragiles et refroidit les températures. Les haies brise-vent (cyprès de Provence, laurier-tin, pittosporum) sont indispensables dans les jardins exposés. Les quartiers abrités (Endoume, Roucas-Blanc) permettent de cultiver des espèces plus fragiles (agrumes, bougainvilliers). La taille moyenne des jardins marseillais (100-300 m² pour une maison) offre plus de possibilités qu'à Paris, et le potager provençal (tomates, courgettes, basilic, aubergines) est une tradition vivace.